Comment installer des packages depuis…

  • Bioconductor ?
    1. Installer le package BiocManager depuis le CRAN
    2. Exécuter la commande BiocManager::install("le_nom_du_package")
  • GitHub ?
    1. Installer devtools
    2. Exécuter la commande devtools::install_github("username/repository").
  • Du code source ?
    1. Mettre le source.tar.gz dans son dossier de travail…
    2. ou l’inverse.
    3. Exécuter la commande install.package("source.tar.gz", repos = NULL, type = "source").

Exercices

Installez le package du cours

Dans le cadre de ce cours, j’ai créé un package R contenant :

  • les slides (html)
  • les données fruits (csv, xlsx, et RData)
  • des TDs interactifs (html)

Installez ce package avec la commande

remotes::install_github("vguillemot/minidebuter")

Explorez la documentation du package

  1. Charger le package : library(minidebuter)
  2. Regardez l’aide “générale” du package : ?"minidebuter-package"
  3. Regardez l’aide la fonction bonjour: ?bonjour
  4. Regardez l’aide du jeu de données fruits: ?fruits

Les tutoriels !

Vous pouvez y accéder sur la page du site, mais ils sont aussi disponibles dans un onglet spécial si vous travaillez avec Rstudio > 1.3